Die Wolfram-Lösung für Bioinformatik
Wenden Sie auf der Grundlage Ihrer oder unserer Daten anspruchsvolle symbolische und numerische Analysen an, visualisieren Sie, generieren Sie interaktive Berichte oder Sofortanwendungen - alles in einem System, mit einem integrierten Workflow.
Die Wolfram-Lösung für Bioinformatik integriert nahtlos spezialisierte Fähigkeiten wie eingebaute berechnungsfähige Genom- und Proteindaten und Sequenzalignment, und bietet gleichzeitig die zuverlässigste Berechnungs-, Entwicklungs- und Bereitstellungsumgebung mit dem höchsten Automatisierungsgrad, die es gibt.
- Ihr Vorteil mit Wolfram
- Wolfram im Vergleich
- Schlüsselfähigkeiten
Wolfram-Technologien beinhalten Tausende eingebaute Funktionen für folgende Anwendungsbereiche:
- Modellieren biologischer Systeme mit Wolfram System Modeler
- Schnelles Durchsuchen des menschlichen Genoms
- Erzeugen von Sequenzalignments in einer berechnungsfähigen Form
- Rasches Visualisieren großer Sequenzalignments
- Schnelles Vergleichen von Genstrukturen
- Visualisieren biologischer Reaktionsnetzwerke mit Wolfram System Modeler
- Generieren von akkuraten Protein-Renderings unter Verwendung integrierter Proteinstruktur-, Element- und Farbdaten
- Rasches Visualisieren von Proteinsequenzalignments
- Verwenden integrierter Proteinstrukturdaten zur Erzeugung von Ramachandran-Diagrammen, Visualisierung von Proteinfaltungen u.v.m.
- Visualisieren von Netzwerken der Geninteraktion
- Schnelles Entwickeln und Testen von Algorithmen
- Einfaches Einbinden von Legacy-Daten mit verwendungsbereiten kuratierten Genom- und Proteindaten in einer leistungsstarken Rechenumgebung
- Erstellen interaktiver Anwendungen und sofortiges Bereitstellen mit dem Wolfram Player
Bietet Ihre aktuelle Software diese Vorteile?
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Die Eingabe in freier Form führt im Handumdrehen zu Ergebnissen, ohne zwingende Syntax
Nur mit Wolfram-Technologien -
Integrierte kuratierte Genom- und Proteomdaten, verwendungsbereit ohne Vorverarbeitung
Nur mit Wolfram-Technologien -
High-Level-Sprache mit automatischer Schnittstellenerzeugung für schnelles Prototypisieren von Anwendungen
BioPerl, BioJava und BioPython erfordern umfangreichen Code, um interaktive Anwendungen zu prototypisieren -
Mächtige integrierte Statistik- und Graphiktools zur Analyse von Genom-, Proteom- und anderen Daten
R-Projekte wie Bioconductor beschränken sich auf Genomdaten -
Integrierte High-Level-Berechnungen und automatische Berichterstellung
BioPerl, BioJava und BioPython bieten keine automatische Berichterstellung -
Benutzerfreundliche Parallelrechen-Fähigkeiten zum Lösen von rechen- oder datenintensiven Aufgaben auf Mehrkern-Computern
In allen anderen Systemen ist umfangreicher Code für Parallelprozesse erforderlich -
Vollständiger High-Level-Workflow dank symbolischer Funktionsarchitektur
R bietet keine eingebaute symbolische Funktionalität
Bioinformatik-spezifische Funktionalitäten:
- Integrierte, laufend aktualisierte Daten zum menschlichen Genom »
- Integrierte Load-on-Demand-Daten zu allen menschlichen Referenzproteinen »
- Schnelle Exact-Match-Suchen nach Sequenzen im menschlichen Genom »
- Integrierter Zugang zu Genstrukturinformationen, Genfunktions-Metadaten und Ontologie
- Eingebaute Information zu Chromosomen und Chromosomenbanden
- Einfacher Import von Affymetrix, GenBank, EDF, FASTA, NEXUS, PDB und anderen Datenformaten »
- Funktionen für zusammenhängende und nicht zusammenhängende gemeinsame Sequenzabschnitte »
- Sequenzalignment unter Verwendung lokaler oder globaler Methoden wie Smith–Waterman-, Needleman–Wunsch-Algorithmen, etc. »
- Partitionierung von Datenbeständen durch Clusteranalyse, Nächste-Nachbarn-Klassifikation und andere Methoden »
- Die Eingabe in freier Form führt im Handumdrehen zu Ergebnissen, ohne zwingende Syntax »
- Integrierte Funktionen im Bereich Graphentheorie zur Bestimmung der kürzesten Pfade, Graphenisomorphismen und mehr
- Umfangreiche Verknüpfungs- und Konnektivitätsfunktionen mit Datenbanken und Java-, C- und .NET-Codes »
- Umfassende String- und Listenmanipulationen, auch mit regulären Ausdrücken »
- Automatische Umwandlung kompilierbarer Wolfram Language-Programme in C-Code, als Standalone-Programme oder zur Integration mit anderen Systemen
Wolfram System Modeler ist das umfassendste physikalische Modellierungs- und Simulationswerkzeug für High-Fidelity-Modellierung. Die Funktionen umfassen:
- Verwenden der eingebauten BioChem-Library zur Modellierung biologischer Systeme »
- Import und Export von Systems Biology Markup Language (SBML)-Modellen »
- Visualisierung von biologischen Reaktionsnetzwerken »
- Nahtlose Verbindung mit Mathematica für den ultimativen integrierten Modellierungs-, Simulations- und Analyse-Workflow
Diese Unternehmen nutzen Wolfram-Technologien
Technische Beratung
Die globalen Experten für computergestützte Berechnung helfen Ihnen gerne bei Ihrem Projekt jeder Größe und auf jeder Ebene. Wir bei Wolfram wissen, was mit Computertechnologie möglich ist, weil wir bei der Entwicklung dieser Technologie weltweit führend sind. Dadurch verfügen wir über eine beispiellose Expertise bei der Anwendung dieser Technologie in einer Vielzahl von Bereichen. Ob für Einzelunternehmer, Organisationen oder Unternehmen, vom Konzept bis zur Verteilung, unsere Experten beraten Sie gerne dabei, wie Sie robuste Ergebnisse mit weniger Zeit und Aufwand erzielen. Lassen Sie uns noch heute an Ihrem Projekt teilhaben!