La solución Wolfram para la Bioinformática
Importe sus propios datos o los nuestros, aplique sofisticados análisis simbólicos y numéricos, visualice, genere informes interactivos o aplicaciones instantáneas, todo en un solo sistema, con un solo flujo de trabajo integrado.
La solución Wolfram para la bioinformática integra de manera fluida capacidades especializadas, como los datos computables incorporados de proteínas y genomas y el alineamiento de secuencias, y a la vez proporciona el entorno de cálculo, desarrollo e implementación más automatizado y confiable.
- La ventaja Wolfram
- Cómo se compara Wolfram
- Capacidades principales
Las tecnologías Wolfram incluyen miles de funciones incorporadas que le permiten:
- Modelar sistemas biológicos con Wolfram System Modeler
- Realizar búsquedas rápidas del genoma humano
- Generar alineamientos de secuencias de manera computable
- Visualizar rápidamente alineamientos de secuencias a gran escala
- Comparar rápidamente estructuras de genes
- Visualizar redes de reacciones biológicas con Wolfram System Modeler
- Generar representaciones precisas de proteínas utilizando datos incorporados de estructuras, elementos y colores de proteínas
- Visualizar de manera instantánea alineamientos de secuencias de proteínas
- Utilizar datos incorporados de estructuras de proteínas para generar gráficos de Ramachandran, visualizar pliegues de proteínas, y más
- Visualizar redes de interacción de genes
- Desarrollar y realizar pruebas de algoritmos rápidamente
- Integrar de manera sencilla datos heredados con datos genómicos y de proteínas, curados y listos para su uso en un poderoso entorno computacional
- Construir aplicaciones interactivas e implementarlas de manera inmediata con Wolfram Player
¿Su conjunto de herramientas actual cuenta con las siguientes ventajas?
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Entradas lingüísticas de formato libre que producen resultados inmediatos sin necesidad de sintaxis
Sólo en las tecnologías Wolfram -
Datos incorporados genómicos y de proteínas, listos para su uso sin necesidad de preprocesamiento
Sólo en las tecnologías Wolfram -
Lenguaje de alto nivel con creación automatizada de interfaces para una rápida elaboración de prototipos de aplicaciones
BioPerl, BioJava y BioPython requieren programación extensiva para crear prototipos de aplicaciones interactivas -
Poderosas herramientas gráficas y estadísticas incorporadas para analizar datos genómicos y proteómicos, entre otros
Los proyectos R como Bioconductor sólo están centrados en datos genómicos -
Generación de informes y computación incorporados y de alto nivel
BioPerl, BioJava y BioPython no cuentan con generación automática de informes -
Capacidades de computación paralela fáciles de usar para resolver problemas de uso intensivo de datos o cálculos en equipos multinúcleo
Se requiere de programación extensiva para paralelizar procesos en todos los demás sistemas -
Flujo de trabajo integral de alto nivel, habilitado por arquitectura de funciones simbólicas
R no cuenta con funcionalidad simbólica incorporada
Capacidades específicas para bioinformática:
- Acceso incorporado a datos sobre el genoma humano actualizados constantemente »
- Datos incorporados sobre todas las proteínas humanas de referencia, descargados bajo pedido »
- Búsquedas rápidas de coincidencias exactas para secuencias en el genoma humano »
- Acceso incorporado a información sobre estructuras de genes, metadatos de funciones de genes, y ontología
- Información incorporada sobre cromosomas y bandeo
- Importación sencilla de formatos de datos Affymetrix, GenBank, EDF, FASTA, NEXUS, PDB, entre otros »
- Funciones para subsecuencias comunes contiguas y no contiguas »
- Alineamiento de secuencias mediante métodos locales o globales como los de Smith-Waterman, Needleman-Wunsch, y más »
- Partición de datos mediante análisis de clústeres, vecinos más próximos, y más »
- Entradas lingüísticas de formato libre que producen resultados inmediatos sin necesidad de sintaxis »
- Funciones incorporadas de teoría de grafos para determinar los caminos más cortos, isomorfismo de grafos, y más
- Extensas capacidades de vinculación y conectividad a bases de datos, y código de Java, C y .NET »
- Manipulaciones avanzadas de cadenas y listas generales, incluyendo notación de expresiones regulares »
- Convierta programas compilables de Wolfram Language de manera automática a código C para uso independiente o integración con otros sistemas
Wolfram System Modeler es la herramienta más completa de modelado físico y la simulación para modelado de alta fidelidad. Sus capacidades incluyen:
- Use la biblioteca incorporada BioChem para modelar sistemas biológicos »
- Importe y exporte modelos de lenguaje de marcado para biología sistémica (SBML por sus siglas en inglés) »
- Visualice redes de reacciones biológicas »
- Conéctese a Mathematica de manera fluida para experimentar el flujo de trabajo incorporado definitivo para modelado, simulación y análisis
Organizaciones que utilizan las tecnologías Wolfram
Soluciones de asesoramiento
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