A solução Wolfram para Bioinformática
Carregue seus dados ou os nossos, aplique análises simbólicas e numéricas sofisticadas, visualize, gere relatórios interativos ou aplicativos instantâneos—tudo em um sistema, com um fluxo de trabalho integrado.
A solução Wolfram para bioinformática integra perfeitamente recursos especializados—como genoma computável integrado e dados de proteína e alinhamento de sequência—enquanto fornece o ambiente de computação, desenvolvimento e implantação mais automatizado e confiável disponível.
- Vantagens
- Comparativos
- Principais recursos
As tecnologias Wolfram incluem milhares de funções integradas permitindo que você:
- Modele sistemas biológicos com o Wolfram System Modeler
- Pesquise rapidamente o genoma humano
- Gere alinhamentos de sequência em uma forma computável
- Visualize rapidamente alinhamentos de sequência em grande escala
- Compare rapidamente estruturas genéticas
- Visualize redes de reação biológica com o Wolfram System Modeler
- Gere renderizações precisas de proteínas usando estrutura de proteína integrada, elemento e dados de cor
- Visualize instantaneamente alinhamentos de sequência de proteínas
- Use dados de estrutura de proteína integrados para gerar gráficos de Ramachandran, visualizar dobras de proteínas e muito mais
- Visualize redes de interação de genes
- Desenvolva e teste algoritmos rapidamente
- Integre facilmente dados antigos com dados genômicos e de proteínas selecionados, prontos para uso em um poderoso ambiente computacional
- Construa aplicativos interativos e implemente-os imediatamente com o Wolfram Player
Seu atual conjunto de ferramentas tem essas vantagens?
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A entrada linguística com linguagem natural produz resultados imediatos sem a necessidade de sintaxe
Exclusivo das tecnologias Wolfram -
Dados genômicos e proteômicos selecionados e integrados, prontos para uso sem pré-processamento
Exclusivo das tecnologias Wolfram -
Linguagem de alto nível com construção de interface automatizada para prototipagem rápida de aplicativos
BioPerl, BioJava e BioPython requerem programação extensa para prototipar aplicativos interativos -
Poderosas ferramentas estatísticas e gráficas integradas para analisar dados genômicos, proteômicos e outros
Projetos R, como Bioconductor, focam apenas em dados genômicos -
Computação integrada de alto nível e geração automática de relatórios
BioPerl, BioJava e BioPython não incluem geração automática de relatórios -
Recursos de computação paralela fáceis de usar para resolver problemas de computação ou dados intensivos em computadores com vários núcleos
É preciso uma programação extensa para paralelizar processos em todos os outros sistemas -
Fluxo de trabalho completo de alto nível habilitado pela arquitetura de função simbólica
R não tem funcionalidade simbólica embutida
Recursos específicos para bioinformática:
- Acesso integrado a dados continuamente atualizados sobre o genoma humano padrão »
- Dados integrados para carregar conforme necessidade de todas as proteínas humanas »
- Pesquisas rápidas de correspondência exata para sequências no genoma humano »
- Acesso integrado à informação da estrutura do gene, metadados da função do gene e ontologia
- Cromossomo integrado e informações de bandeamento
- Importação fácil de Affymetrix, GenBank, EDF, FASTA, NEXUS, PDB e outros formatos de dados »
- Funções para subsequências comuns contíguas e não contíguas »
- Alinhamento de sequência usando métodos locais ou globais, como Smith–Waterman, Needleman–Wunsch e muito mais »
- Particionar dados usando análise de cluster, vizinhos mais próximos e muito mais »
- Particionamento de dados usando análise de cluster, vizinhos mais próximos e muito mais »
- Funções integradas de teoria de grafos para determinar caminhos mais curtos, isomorfismos de grafos e muito mais
- Recursos de conexão e conectividade extensos com bancos de dados e códigos Java, C e .NET »
- Manipulações avançadas de cadeia de caracteres e lista geral, incluindo notação de expressão regular »
- Converta automaticamente programas compiláveis da Wolfram Language em código C, para uso independente ou integração com outros sistemas
O Wolfram System Modeler é a ferramenta de modelagem e simulação física mais completa para modelagem de alta fidelidade. Os recursos incluem:
- Biblioteca BioChem integrada para modelar sistemas biológicos »
- Importação e exportação de modelos em SBML (Systems Biology Markup Language, Linguagem de Marcação para Biologia Sistêmica) »
- Visualize redes de reação biológica »
- Conecte-se facilmente com o Mathematica para obter o máximo em modelagem integrada, simulação e fluxo de trabalho de análise
Consultoria
Recrute os melhores especialistas em computação do mundo para ajudar em seus projetos—de qualquer tamanho, de qualquer nível. Na Wolfram, sabemos o que é possível com a tecnologia computacional porque somos líderes globais em sua criação. Possuímos uma experiência extraordinária em aplicá-la ao trabalho de consultoria em várias áreas. Seja individual ou empresarial, do conceito à implementação, nossos especialistas em computação podem ajudá-lo a obter resultados robustos com menos tempo e esforço. Vamos começar com seu projeto hoje