Wolfram 解决方案生物信息学
无论提取您的数据或我们的内置数据，应用先进的符号和数值分析，进行可视化处理，还是生成互动报告或即时应用程序，所有这些操作都可在统一系统中利用一个集成的工作流程完成。
Wolfram 生物信息的解决方案完美地将如内置可计算基因组和蛋白质的数据以及基因序列比对等各种专用功能集成在一起，并提供最自动化以及最可靠的计算、开发和部署环境。
- Wolfram 的优势
- Wolfram 如何比较
- 主要功能
Wolfram 技术包括数千种内置函数能够帮助您：
- 用 Wolfram System Modeler 构建生物系统模型
- 人类基因组的快速查询
- 生成可计算形式的基因序列比对
- 大规模基因序列比对的快速可视化
- 快速比较基因结构
- 用 Wolfram System Modeler 可视化生物反应网络
- 使用整合的蛋白质结构，元素和颜色数据生成准确的蛋白质渲染图
- 蛋白质序列比对的即时可视化
- 利用内置蛋白质结构数据，生成 Ramachandran 图线、蛋白质折叠的可视化图形等等
- 可视化基因相互作用网络
- 算法的快速开发和测试
- 在强大的计算环境中，轻松集成历史数据和即可使用的精选基因和蛋白质数据
- 构建交互式应用程序，并且使用 Wolfram Player 对它们进行立即部署
您现有的工具集是否有以下优势？
-
自由格式语言输入可立即产生结果，并且无需使用编程语法
Wolfram 技术独有特性 -
内置精选基因和蛋白质数据，无需预处理即可使用
Wolfram 技术独有特性 -
带有自动界面构建的高级语言，可用于快速创建应用程序的原型系统
BioPerl、BioJava 和 BioPython 需要大量的程序设计，以创建互动应用程序的原型系统 -
功能强大的集成统计和图形工具，可用于分析基因组、蛋白质组和其他数据
R 项目如 Bioconductor 只注重于基因组数据 -
内置高层次的计算和自动报告的生成
BioPerl、BioJava 和 BioPython 不含有自动报告生成功能 -
易于使用的并行计算功能，可以解决多核计算机上的密集型计算或数据问题
若要在任何其他系统中，对进程进行并行化处理，必须使用大量的程序设计 -
符号函数体系结构驱动了整个高级工作流程
R 语言不具备内置符号计算功能
Wolfram 语言囊括了上千种用于计算、建模、可视化、开发和部署的内置函数 »
生物信息学的专业功能：
- 访问关于标准人类基因组的内置数据，这些数据还在不断更新中 »
- 可按需下载的全部人类参考蛋白质的集成数据 »
- 人类基因组序列的快速精确匹配查询 »
- 整合基因结构信息、基因函数元数据、存在论的访问
- 内置染色体和分带信息
- 轻松导入 Affymetrix、GenBank、EDF、FASTA、NEXUS、PDB 和其他数据格式 »
- 相邻和非相邻的共同子序列的函数 »
- 利用 Smith-Waterman、Needleman-Wunsch 等局部或全局方法进行基因序列比对 »
- 利用聚类分析、最近邻等方法划分数据 »
- 自由格式语言输入可立即产生结果，无需使用编程语法 »
- 内置图论函数，用于确定最短路径、图的同构等
- 与数据库、Java、C 和 .NET 代码的全面连接功能 »
- 高级字符串和普通列表操作，包括标准表达式符号 »
- 把可兼容 Wolfram 语言程序自动转换成 C 代码，用以单独使用或者与其他系统兼容使用
Wolfram System Modeler 是用于高保真建模的最完整的物理建模和仿真工具，能够帮助您：
- 使用内置 BioChem 库构建生物系统模型 »
- 导入和导出系统生物标记语言（SBML）模型 »
- 可视化生物反应网络 »
- 与 Wolfram 语言无缝连接，以实现最终的集成建模、仿真和分析工作流程
"We're able to work in this really coherent fashion where when any one of us makes progress, the whole group makes progress."
Brian FrezzaCo-founder & Co-CEO, Emerald Therapeutics
"Mathematica is an indispensable puzzle-solving tool for biological sciences, which are becoming increasingly more quantitative."
Melih SenerBiophysicist, University of Illinois at Urbana-Champaign
"As more data about this outbreak becomes available, we can instantly import it, redo our calculations and get better results. Then, we can improve predictions and design better control policies."
Zhilan FengProfessor of Mathematics, Purdue University
"It's a remarkably diverse collection of functionalities.... You're stunned by the things it can do. It's my desert-island application."
David DeBrotaSenior Clinical Research Physician
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