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Modélisez, simulez et visualisez les systèmes biologiques et biochimiques. Modélisez et simulez la cinétique des réactions.

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Glycolyse : étude des oscillations dans les cellules de levure

Les oscillations glycolytiques dans les cellules de levure de l’espèce Saccharomyces cerevisiae sont un phénomène bien étudié. Cet exemple simule les oscillations à proximité d’une bifurcation dite de Hopf. La modification légère d’un paramètre autour du point de bifurcation modifie qualitativement le comportement du système.

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Importez des modèles SBML

Importez facilement le modèle au format Systems Biology Markup Language (SBML).

Simulez différents scénarios

Comparez la façon dont de petits changements dans le paramètre de bifurcation affectent les oscillations des concentrations de protéines et de molécules.

Exemple de modèle BioChem
pour la glycolyse des levures.
Composante du cytosol.
Oscillations de l’ATP des différents côtés
du point de bifurcation.

Visualisez les réseaux de réactions biologiques

Utilisez la bibliothèque BioChem intégrée pour visualiser et simuler le modèle.

Hynne et al., 2001. Modèle à grande échelle de glycolyse chez les Saccharomyces cerevisiae.
Chimie biophysique. 94(1-2):121-63.
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