Biologie informatique
Modélisez, simulez et visualisez les systèmes biologiques et biochimiques. Modélisez et simulez la cinétique des réactions.
Catalyse enzymatique
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Introduction
La plupart des enzymes sont des protéines et elles augmentent la vitesse des réactions dans les organismes en réduisant l’énergie d’activation nécessaire à la réaction. Sans enzymes, certains processus du corps humain prendraient des jours, voire des décennies. Les enzymes défectueuses sont liées à un certain nombre de maladies et d’états pathologiques, tels que l’intolérance au lactose.
Le modèle
Le modèle consiste en un substrat qui est converti soit par une réaction enzymatique, soit par une réaction non enzymatique. La voie enzymatique est une alternative beaucoup plus rapide, même si elle est plus complexe. Le complexe enzymatique stabilise l’état de transition, réduisant ainsi l’énergie d’activation de la réaction.
Le substrat devient un produit
Le modèle contient à la fois une voie non enzymatique et une voie enzymatique.
Simulation
Le téléchargement comprend un notebook Mathematica avec une interface utilisateur graphique construite à l’aide de la fonction Manipulate. Utilisez-la pour explorer le comportement de la réaction, avec des paramètres ajustables pour les concentrations de substrat et d’enzyme.
Analyse simplifiée
L’effet de l’enzyme peut être facilement analysé à l’aide de l’interface graphique dynamique simple incluse dans le téléchargement.
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