Biologie informatique
Modélisez, simulez et visualisez les systèmes biologiques et biochimiques. Modélisez et simulez la cinétique des réactions.
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Récepteurs couplés aux protéines G
Parmi tous les médicaments thérapeutiques actuellement utilisés, environ 40 à 50 % sont centrés sur les mécanismes des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG). Ici, nous utilisons la fonction d’importation SBML dans Wolfram System Modeler pour importer un modèle qui décrit le comportement des RCPG et des protéines G dans une cellule de levure.
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Régulation allostérique expliquée avec ATCase
La régulation allostérique est une cible privilégiée pour les médicaments car elle réduit le risque de surdosage et d’effets secondaires et peut être utilisée pour affiner les processus pharmacologiques. Ce modèle étudie une réaction allostérique naturelle : la première étape de la synthèse de la pyrimidine, catalysée par l’enzyme allostérique aspartate carbamoyltransférase (ATCase).
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Immunité collective
Lorsqu’un pourcentage important de la population est immunisé contre une maladie telle que la COVID-19, on peut considérer que la population est protégée contre la maladie par l’immunité collective. Cela signifie que même si 100 % de la population n’est pas vaccinée, une proportion suffisante de la population l’est et le taux d’infection commence à diminuer. Dans cet exemple, vous étudierez le concept d’immunité collective à l’aide du modèle SIR (sensible, infecté et guéri).
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Membrane plasmique
La membrane plasmique agit non seulement comme une barrière cellulaire, mais elle contrôle également ce qui entre et sort de la cellule. Dans cet exemple, vous explorerez le concept d’osmose et la manière dont les concentrations molaires des solutés affectent le mouvement de l’eau à travers une membrane semi-perméable.
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Ibuprofène
La plupart des gens ont déjà eu des maux de tête qui les empêchaient de se concentrer sur leurs tâches. Dans cet exemple, vous allez étudier comment l’ibuprofène peut soulager les maux de tête. Votre objectif est de trouver le dosage le plus efficace pour soulager les maux de tête sans effets secondaires.
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Métabolisme alimentaire
Comment la nourriture que vous consommez affecte-t-elle votre corps et quel type d’aliments devriez-vous consommer pour développer vos muscles ? La plupart des gens se sont posé cette question au moins une fois. Dans cet exemple, vous découvrirez comment les aliments que vous choisissez contribuent à la prise de masse graisseuse et musculaire.
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Sélection naturelle
La sélection naturelle est fondamentale pour comprendre comment les populations évoluent au fil du temps. Elle permet de comprendre pourquoi certaines caractéristiques disparaissent alors que d’autres se développent. Dans cet exemple, vous explorerez l’effet des pressions de sélection environnementale sur la composition génétique d’une population.
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Tests génétiques
Les tests génétiques sont un outil important, non seulement dans le domaine clinique, mais aussi dans celui de la recherche. Dans cet exemple, vous explorerez comment l’ADN est manipulé dans les tests génétiques. Vous utiliserez la réaction en chaîne de la polymérase (PCR) pour amplifier un échantillon d’ADN et utiliserez ensuite l’électrophorèse pour diagnostiquer les patients atteints de maladies génétiques.
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Hérédité liée au sexe
Tous les caractères ne sont pas hérités sur les autosomes : il existe un grand nombre de caractères hérités sur les chromosomes sexuels. Dans cet exemple, vous explorerez la façon dont les caractères sont hérités sur les chromosomes sexuels et comment cela affecte la proportion d’individus avec chaque génotype dans la population.
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Équilibre de Hardy–Weinberg
Le principe de Hardy–Weinberg est un principe fondamental de la génétique des populations. Il décrit les populations qui ne subissent plus d’évolution et atteignent donc un état stable. Dans cet exemple, vous apprendrez à construire un modèle de patrimoine génétique et à analyser des scénarios dans lesquels les hypothèses de l’équilibre de Hardy–Weinberg ne sont pas respectées.
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