SBMLモデルをインポートし，それを使ってホップ分岐付近の振動を調べます．

生化学的プロセスをモデル化し，脂肪細胞内のインスリンのシグナル伝達がどのように働くのかを調べます．

食物摂取後の人体において，健全な血糖値を維持する過程のシミュレーションを行います．

体内の各部における造影剤の分布と伝達速度を記述する薬物動態モデルを作成します．

現在使われているすべての治療薬剤の中で，ほぼ40-50%がいわゆるGタンパク質共役受容体(GPCR)のメカニズムを標的としています．ここではWolfram System ModelerのSBMLインポート関数を使って，酵母細胞中のGPCRおよびGタンパク質の挙動を記述するモデルをインポートします．

薬物動態モデルおよび薬力学モデルを構築して投与量選択過程を理解します．

アロステリック制御は薬物の過剰摂取や副作用を軽減し薬理過程を微調整するために使うことができるため，創薬における主な標的となっています．このモデルでは，アロステリック酵素のアスパラギン酸カルバモイルトランスフェラーゼ(ATCase)によって触媒される，ピリミジン生合成の最初のステップである自然に発生するアロステリック反応を調べます．

ネガティブフィードバック，アロステリック効果，共同性の影響を受けない簡単な控訴反応はミカエリス・メンテン式 を使って簡約することができます．

酵素は，ヒトの代謝作用からビールの醸造に至る既知の生化学反応のほとんどすべてに関与しています．このモデルは反応生成物の一般的な基質を示し，それに触媒作用を及ぼして酵素の力を描写します．

集団の大部分がCOVID-19等の病気に免疫があると，その集団は集団免疫によって病気から守られていると考えることができます．つまり，集団が100%ワクチン接種していなくても，感染率は下降していくのです．この例ではSIR（感受性保持者，感染者，免疫保持者）モデルを使って集団免疫の概念を調べます．

細胞膜は細胞の壁としての役割を果たすだけではなく，細胞内に摂取するものや細胞から排出するものを制御しています．この例では浸透性の概念および溶質のモル濃度が半透膜での水分の運動にどのような影響を与えるかを調べます．

頭痛がして仕事に集中できなかったという経験がある人も多いことでしょう．この例では，イブプロフェンがどのように頭痛を緩和するのかを学びます．目標は，副作用なしで頭痛を緩和する薬の適量を見付けることです．

「食物が体にどのような影響を与えるのだろうか」とか「何を食べたら筋肉がつくだろう」という疑問は，誰もが一度は持ったのではないでしょうか．この例では，選んだ食べ物がどのように脂肪や筋肉の構築に寄与しているかを調べます．

自然淘汰は集団が時間の経過とともにいかに進化するかを理解する上で基本となるものです．進化する形質もあれば，なくなっていく形質もある理由を理解するのに役立ちます．この例では環境淘汰圧が集団の遺伝子構造に及ぼす影響を調べます．

遺伝子検査は医療現場だけではなく研究にも重要なツールです．この例では遺伝子検査でDNAがどのように操作されるかを調べます．ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使ってDNAサンプルを増幅し，電気泳動を使って遺伝的疾患を持つ患者を診断します．

すべての形質が常染色体上で受け継がれるわけではありません．性染色体で受け継がれる形質もたくさんあります．この例では，形質が性染色体上でどのように受け継がれ，これが集団で各遺伝子型を持つ個人の割合にどのような影響を及ぼすかを調べます．

ハーディー・ワインベルグの法則は集団遺伝学における基本的な法則です．これは，もうそれ以上進化しない定常状態に達した集団を説明するものです．この例では，遺伝モデルを構築してハーディー・ワインベルグ平衡が 破られるときのシナリオを解析します．